勤務体系を削除すると、どのような影響がありますか

すでに登録されている勤務データには影響ありません。

［勤務スケジュール］メニューの各メニュー、［タイムカード入力］メニューでは、削除した勤務体系は選択できません。
また、［就業月報］メニュー／［勤務一覧表］メニュー／［月次推移表］メニューの各条件設定画面の［集計項目］ページで、削除した勤務体系の勤務回数は選択できません。