FBデータの並び順が口座名義カナ順になる原因を教えてほしい

銀行振込明細の出力順で「口座名義カナ順」が一番上に設定されている可能性があります。
［銀行振込］メニューの［銀行振込 - 条件設定］画面の［出力順］ページで、銀行振込明細を出力したい並び順に変更してください。
並び順の設定方法は、ヘルプセンターの「出力順を設定する」をご参照ください。